Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF3Q9NR23 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms