Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY2Q8WXA3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms