Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms