Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.159e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.689e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.689e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.749e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 PSMD2-220ENST00000496925 723 ntTSL 210.12□□□□□ -0.799e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 PSMD2-206ENST00000439383 2633 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.889e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.919e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 PSMD2-203ENST00000432855 609 ntTSL 39.28□□□□□ -0.929e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 AKAP9-212ENST00000487692 869 ntTSL 26.65□□□□□ -1.349e-9■■■□□ 15.7
TRA2AQ13595 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.232e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.322e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 BRD8-214ENST00000454473 3005 ntTSL 56.76□□□□□ -1.332e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.332e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.382e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 BRD8-211ENST00000441656 2899 ntTSL 56.28□□□□□ -1.42e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 BRD8-224ENST00000512140 2876 ntTSL 26.14□□□□□ -1.432e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 BRD8-205ENST00000418329 2912 ntTSL 55.68□□□□□ -1.52e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 317.6■□□□□ 0.413e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.633e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 AKAP9-209ENST00000484815 671 ntTSL 24.41□□□□□ -1.72e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 NOLC1-204ENST00000464969 2288 ntTSL 210.98□□□□□ -0.651e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 NOLC1-207ENST00000488254 2441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.151e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 NOLC1-208ENST00000603946 3217 ntTSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.191e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.251e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 NOLC1-201ENST00000370007 3727 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.331e-8■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 CASC3-207ENST00000581849 580 ntTSL 222.16■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 526.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 RSRC2-217ENST00000531389 1376 ntTSL 511.19□□□□□ -0.629e-7■■■□□ 15.6
TRA2AQ13595 KNOP1-203ENST00000565844 1394 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-6■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.138e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.048e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.018e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.298e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.328e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.398e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.448e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-216ENST00000591545 5193 ntTSL 212.25□□□□□ -0.458e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.58e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 PRPF40A-212ENST00000545856 1358 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.065e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 PRPF40A-201ENST00000354363 1622 ntTSL 214.37□□□□□ -0.115e-8■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 ILF3-215ENST00000589485 620 ntTSL 220.31■□□□□ 0.846e-16■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 ILF3-207ENST00000587840 655 ntTSL 515.49■□□□□ 0.076e-16■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 ILF3-214ENST00000589416 773 ntTSL 414.72□□□□□ -0.056e-16■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 ILF3-212ENST00000589173 570 ntTSL 514.09□□□□□ -0.156e-16■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 CHD2-203ENST00000625243 361 ntTSL 1 (best)2.13□□□□□ -2.074e-7■■■□□ 15.5
TRA2AQ13595 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.63■□□□□ 0.576e-7■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.066e-7■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.166e-7■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.696e-7■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 HNRNPU-206ENST00000465881 883 ntTSL 56.43□□□□□ -1.388e-14■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 HNRNPU-215ENST00000638589 2225 ntTSL 23.44□□□□□ -1.868e-14■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 33.89□□□□□ -1.792e-12■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.232e-12■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 LUC7L3-211ENST00000507503 561 ntTSL 23.39□□□□□ -1.876e-9■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.873e-7■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.93e-7■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.953e-7■■■□□ 15.4
TRA2AQ13595 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 219■□□□□ 0.635e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 ANKRD12-204ENST00000540578 1338 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.335e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 411.3□□□□□ -0.62e-8■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 ANKRD12-207ENST00000581635 631 ntTSL 410.95□□□□□ -0.665e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CEP85-205ENST00000469609 2384 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CEP85-203ENST00000453146 2821 ntTSL 1 (best)9.63□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 ZNF830-201ENST00000361952 2246 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-8■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.362e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.455e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.465e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 FANCI-212ENST00000566895 4663 ntTSL 25.5□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 PPP1R12A-214ENST00000550299 683 ntTSL 55.05□□□□□ -1.62e-8■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.652e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 PPP1R12A-205ENST00000546762 1257 ntTSL 54.33□□□□□ -1.722e-8■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 FANCI-203ENST00000447611 3690 ntTSL 23.4□□□□□ -1.872e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 FANCI-204ENST00000561894 3268 ntTSL 22.98□□□□□ -1.932e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 ANKRD12-205ENST00000546007 978 ntTSL 52.98□□□□□ -1.935e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 FANCI-210ENST00000565522 233 ntTSL 52.13□□□□□ -2.072e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 ANKRD12-208ENST00000581758 323 ntTSL 51.26□□□□□ -2.215e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CASC3-204ENST00000474190 908 ntTSL 39.94□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CWC25-203ENST00000618122 1160 ntTSL 211.69□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 219.14■□□□□ 0.653e-16■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-16■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.433e-16■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.713e-16■■■□□ 15.3
TRA2AQ13595 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 214.82□□□□□ -0.041e-7■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.491e-12■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 RPL5-205ENST00000497519 1210 ntTSL 29.73□□□□□ -0.851e-12■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-15■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 ANP32A-204ENST00000480858 352 ntTSL 1 (best)14.73□□□□□ -0.052e-11■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 BRD4-211ENST00000602230 751 ntTSL 312.79□□□□□ -0.363e-9■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.74□□□□□ -0.373e-9■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.15e-6■■■□□ 15.2
TRA2AQ13595 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.55e-6■■■□□ 15.2
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 95.8 ms