Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 01e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-210ENST00000588413 747 ntTSL 214.16□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 LTBP4-211ENST00000594537 657 ntTSL 524.33■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 LTBP4-223ENST00000598717 811 ntTSL 520.42■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 LTBP4-208ENST00000593738 302 ntTSL 319.51■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 AC006504.5-206ENST00000585917 719 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 AC006504.5-205ENST00000588318 432 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 39.8
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DDX3XO00571 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.893e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 FHL3-203ENST00000477194 1091 ntTSL 234.23■■■■□ 3.073e-11■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.874e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.664e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 TTYH1-208ENST00000461302 559 ntTSL 423.98■■□□□ 1.434e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.313e-11■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 DVL2-210ENST00000575756 1136 ntTSL 522.63■■□□□ 1.214e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 STK16-212ENST00000496443 2094 ntTSL 222.02■■□□□ 1.124e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.14e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.084e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-218ENST00000543939 1728 ntTSL 321.41■■□□□ 1.024e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.974e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.934e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.932e-12■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 BLOC1S6-217ENST00000568597 592 ntTSL 220.81■□□□□ 0.925e-9■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.925e-9■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 TTYH1-212ENST00000476757 579 ntTSL 320.79■□□□□ 0.924e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 SLC25A43-204ENST00000493093 896 ntTSL 320.75■□□□□ 0.914e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 SLC25A43-203ENST00000488158 2699 ntTSL 220.65■□□□□ 0.94e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 STK16-213ENST00000496800 1243 ntTSL 220.47■□□□□ 0.874e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.844e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 STK16-208ENST00000475696 1513 ntTSL 220.09■□□□□ 0.814e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.84e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 TTYH1-209ENST00000462757 518 ntTSL 419.98■□□□□ 0.794e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.714e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 FHL3-202ENST00000475084 882 ntTSL 519.2■□□□□ 0.663e-11■■■■■ 39.8
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DDX3XO00571 STK16-207ENST00000475342 866 ntTSL 319.1■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.594e-8■■■■■ 39.8
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DDX3XO00571 CLMN-202ENST00000553733 565 ntTSL 418.48■□□□□ 0.554e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-202ENST00000455113 1718 ntTSL 318.4■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 39.8
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DDX3XO00571 USP30-209ENST00000536723 826 ntTSL 517.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 39.8
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DDX3XO00571 CEP120-208ENST00000513565 3973 ntTSL 1 (best)17.63■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-10■■■■■ 39.8
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DDX3XO00571 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.24e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 PDCD6IP-205ENST00000435909 587 ntTSL 516.16■□□□□ 0.186e-17■■■■■ 39.8
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DDX3XO00571 BLOC1S6-220ENST00000569076 557 ntTSL 415.76■□□□□ 0.115e-9■■■■■ 39.8
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DDX3XO00571 PDCD6IP-210ENST00000477798 587 ntTSL 414.87□□□□□ -0.036e-17■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 TTYH1-204ENST00000391739 3678 ntTSL 214.87□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 HRAS-210ENST00000482021 167 ntTSL 314.45□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 BLOC1S6-211ENST00000566184 493 ntTSL 414.41□□□□□ -0.15e-9■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-220ENST00000544725 502 ntTSL 514.2□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-207ENST00000538375 898 ntTSL 313.68□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-12■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-206ENST00000537022 534 ntTSL 413.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 GMPPA-211ENST00000481170 4942 ntTSL 213.48□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CEP120-207ENST00000510582 578 ntTSL 412.58□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 STK16-204ENST00000409638 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-211ENST00000540408 569 ntTSL 212.33□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 COPS7A-213ENST00000542150 658 ntTSL 312.07□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 BLOC1S6-216ENST00000567740 1051 ntTSL 211.96□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 QRSL1-201ENST00000369044 2158 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.514e-14■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 DMAC1-202ENST00000469050 458 ntTSL 311.48□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 YOD1-201ENST00000315927 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.572e-20■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 THEM4-202ENST00000471464 1832 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.584e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 MED18-201ENST00000373842 1833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.66e-17■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 TWISTNB-201ENST00000222567 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.645e-10■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 QRSL1-203ENST00000467262 413 ntTSL 310.73□□□□□ -0.694e-14■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.755e-9■■■■■ 39.8
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