Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.75□□□□□ -1.811e-12■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 522.7■■□□□ 1.222e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 526.74■■□□□ 1.873e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.26e-7■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.966e-7■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.786e-7■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.586e-7■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 GAS5-225ENST00000454813 621 ntTSL 37.28□□□□□ -1.242e-78■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 EEF1B2-211ENST00000482103 587 ntTSL 25.31□□□□□ -1.561e-323■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.961e-323■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNX5-206ENST00000469704 696 ntTSL 332.48■■■□□ 2.791e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 21e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNX5-204ENST00000431277 840 ntTSL 519.42■□□□□ 0.71e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.581e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNX5-203ENST00000419004 778 ntTSL 518.23■□□□□ 0.511e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 OVOL2-204ENST00000486776 550 ntTSL 317.29■□□□□ 0.361e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.23□□□□□ -1.731e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 SNX5-207ENST00000474883 695 ntTSL 54.2□□□□□ -1.741e-41■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 PHF19-207ENST00000456291 888 ntTSL 328.99■■■□□ 2.233e-6■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.843e-6■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 PHF19-204ENST00000436309 558 ntTSL 414.17□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 227.56■■■□□ 23e-9■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.633e-9■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.273e-9■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.223e-9■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 511.58□□□□□ -0.563e-9■■□□□ 14.2
AATFQ9NY61 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.986e-13■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 PLXNA3-208ENST00000495040 421 ntTSL 532.56■■■□□ 2.83e-8■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.353e-8■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 227.89■■■□□ 2.061e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.061e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 227.89■■■□□ 2.061e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.811e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-216ENST00000592857 837 ntTSL 325.8■■□□□ 1.721e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.581e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-210ENST00000588315 1409 ntTSL 224.63■■□□□ 1.531e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-204ENST00000585523 574 ntTSL 424.12■■□□□ 1.451e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 524.12■■□□□ 1.451e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.311e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-208ENST00000586633 566 ntTSL 321.6■■□□□ 1.051e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.631e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SLC25A39-214ENST00000591151 636 ntTSL 217.67■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.022e-7■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.732e-7■■□□□ 14.1
AATFQ9NY61 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)18.26■□□□□ 0.513e-10■■□□□ 14
AATFQ9NY61 AHCTF1-205ENST00000478568 611 ntTSL 420.43■□□□□ 0.863e-14■■□□□ 14
AATFQ9NY61 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 530.68■■■□□ 2.51e-7■■□□□ 14
AATFQ9NY61 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.261e-7■■□□□ 14
AATFQ9NY61 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.361e-7■■□□□ 14
AATFQ9NY61 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.356e-7■■□□□ 14
AATFQ9NY61 NISCH-209ENST00000485765 563 ntTSL 423.18■■□□□ 1.36e-7■■□□□ 14
AATFQ9NY61 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 219.25■□□□□ 0.676e-7■■□□□ 14
AATFQ9NY61 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.056e-7■■□□□ 14
AATFQ9NY61 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.961e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 NUDT4-207ENST00000550056 531 ntTSL 419.34■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 NUDT4-203ENST00000546925 569 ntTSL 414.41□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 NUDT4-204ENST00000547014 1419 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.891e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 UBE2H-208ENST00000490974 572 ntTSL 527.82■■■□□ 2.046e-9■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 UBE2H-203ENST00000472396 758 ntTSL 525.63■■□□□ 1.696e-9■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.246e-9■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.726e-9■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 UBE2H-209ENST00000496698 561 ntTSL 46.17□□□□□ -1.426e-9■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 UBE2H-205ENST00000480245 436 ntTSL 35.1□□□□□ -1.596e-9■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.173e-38■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 HSPA8-209ENST00000526862 504 ntTSL 35.62□□□□□ -1.513e-38■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.53e-38■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.082e-10■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-10■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 319.44■□□□□ 0.71e-6■■□□□ 13.9
AATFQ9NY61 MAPK8IP3-213ENST00000568271 752 ntTSL 517.79■□□□□ 0.441e-6■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 ROR2-203ENST00000476440 316 ntTSL 57.43□□□□□ -1.227e-6■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 210.91□□□□□ -0.661e-323■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 IARS-211ENST00000490438 887 ntTSL 217.29■□□□□ 0.367e-82■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 IARS-203ENST00000395554 1103 ntTSL 516.27■□□□□ 0.27e-82■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.017e-82■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.087e-82■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.197e-82■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.237e-82■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 IARS-204ENST00000430417 414 ntTSL 36.52□□□□□ -1.377e-82■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.637e-82■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 RPL13A-211ENST00000486930 652 ntTSL 319.05■□□□□ 0.642e-37■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.142e-37■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.116e-10■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.956e-10■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 SNRNP70-204ENST00000595231 1673 ntTSL 1 (best)27.23■■□□□ 1.956e-10■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 SNRNP70-209ENST00000601065 1757 ntTSL 326.43■■□□□ 1.826e-10■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 SNRNP70-202ENST00000401730 3144 ntTSL 219.45■□□□□ 0.76e-10■■□□□ 13.8
AATFQ9NY61 RPS6KA1-210ENST00000525525 543 ntTSL 532.57■■■□□ 2.83e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 RPS6KA1-212ENST00000526040 500 ntTSL 532.57■■■□□ 2.83e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 CPOX-205ENST00000515041 1030 ntTSL 229.76■■■□□ 2.351e-9■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.113e-6■■□□□ 13.7
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