Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 BCLAF1-208ENST00000528229 573 ntTSL 27.37□□□□□ -1.232e-14■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ATAD2-202ENST00000517666 4995 ntTSL 512.48□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ATAD2-204ENST00000521496 3133 ntTSL 1 (best)10.62□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)6.58□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 LDLR-212ENST00000560467 928 ntTSL 311.91□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 NKTR-204ENST00000445842 560 ntTSL 523.67■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 KLHL36-203ENST00000564159 2618 ntTSL 214.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-222ENST00000570063 1821 ntTSL 518.14■□□□□ 0.491e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.341e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-217ENST00000568254 2013 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.141e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-212ENST00000565733 772 ntTSL 314.33□□□□□ -0.121e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-205ENST00000475766 525 ntTSL 410.33□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-206ENST00000491378 487 ntTSL 36.59□□□□□ -1.351e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 RSRP1-213ENST00000566395 824 ntTSL 34.64□□□□□ -1.671e-11■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 ZNF451-207ENST00000444273 3402 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 ZNF451-211ENST00000504603 561 ntTSL 52.56□□□□□ -24e-9■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.094e-9■■■■■ 32.4
RBM22Q9NW64 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 214.37□□□□□ -0.114e-20■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.944e-20■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 ARHGAP17-205ENST00000570841 571 ntTSL 310.47□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 CLCN7-205ENST00000563642 4184 ntTSL 213.64□□□□□ -0.237e-12■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 MON2-205ENST00000547095 5708 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC10.77□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 MON2-210ENST00000551307 2640 ntTSL 21.6□□□□□ -2.152e-6■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 MON2-206ENST00000547287 569 ntTSL 31.09□□□□□ -2.232e-6■■■■■ 32.3
RBM22Q9NW64 WAC-211ENST00000442148 759 ntTSL 519.66■□□□□ 0.749e-9■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.659e-9■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.399e-9■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.19e-9■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 WAC-207ENST00000420266 784 ntTSL 513.98□□□□□ -0.179e-9■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.369e-9■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.579e-9■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 WAC-208ENST00000424454 1330 ntTSL 24.99□□□□□ -1.619e-9■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.454e-11■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 MIPEP-203ENST00000464194 543 ntTSL 214.65□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 MIPEP-202ENST00000433710 494 ntTSL 314.65□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 32.2
RBM22Q9NW64 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.593e-8■■■■■ 32.1
RBM22Q9NW64 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 32.1
RBM22Q9NW64 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 32.1
RBM22Q9NW64 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 514.65□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 32.1
RBM22Q9NW64 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 32.1
RBM22Q9NW64 CHD2-221ENST00000635856 4236 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 USP10-208ENST00000563386 590 ntTSL 419.05■□□□□ 0.644e-9■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 USP10-205ENST00000562743 888 ntTSL 218.42■□□□□ 0.544e-9■■■■■ 32
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RBM22Q9NW64 USP10-204ENST00000562283 569 ntTSL 415.88■□□□□ 0.134e-9■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 USP10-202ENST00000540269 3070 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 USP10-207ENST00000563048 1315 ntTSL 211.88□□□□□ -0.514e-9■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 39.82□□□□□ -0.844e-9■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 33.11□□□□□ -1.914e-9■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 HIF1A-206ENST00000553999 616 ntTSL 420.72■□□□□ 0.914e-17■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 HIF1A-211ENST00000557446 559 ntTSL 519.92■□□□□ 0.784e-17■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.774e-17■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.784e-17■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.984e-17■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 213.14□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.477e-6■■■■■ 32
RBM22Q9NW64 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 C1orf159-211ENST00000465822 1933 ntTSL 216.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 C1orf159-219ENST00000487177 3315 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 212.61□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 PRR4-213ENST00000546265 534 ntTSL 512.08□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.515e-14■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.735e-14■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.735e-14■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 CNNM3-203ENST00000465224 2607 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.935e-14■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.475e-6■■■■■ 31.9
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