Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.146e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SCLY-217ENST00000482031 1038 ntTSL 314.17□□□□□ -0.146e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 ZNF180-206ENST00000590088 3131 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.176e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.176e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 TPT1-208ENST00000527226 613 ntTSL 213.96□□□□□ -0.176e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNRPN-209ENST00000579070 871 ntTSL 313.9□□□□□ -0.186e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.26e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SCLY-206ENST00000423324 628 ntTSL 413.75□□□□□ -0.216e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.216e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNURF-203ENST00000580062 796 ntTSL 313.72□□□□□ -0.216e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNRPN-210ENST00000584968 908 ntTSL 513.62□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 C3orf33-203ENST00000482061 1926 ntTSL 213.43□□□□□ -0.266e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SCLY-207ENST00000431487 568 ntTSL 513.27□□□□□ -0.296e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 POLE-208ENST00000535934 1561 ntTSL 513.08□□□□□ -0.326e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.346e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 ANKRD20A5P-206ENST00000581363 582 ntTSL 312.8□□□□□ -0.366e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.446e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 ZNF180-211ENST00000592529 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.516e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 NHSL1-205ENST00000468095 459 ntTSL 311.81□□□□□ -0.526e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 C3orf33-204ENST00000486435 864 ntTSL 511.79□□□□□ -0.526e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 C3orf33-202ENST00000465810 733 ntTSL 511.75□□□□□ -0.536e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SCLY-210ENST00000440143 415 ntTSL 311.69□□□□□ -0.546e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.546e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.586e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 CACNB2-208ENST00000377331 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.596e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.66e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.636e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.686e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 ZNF180-209ENST00000592095 3270 ntTSL 1 (best)10.62□□□□□ -0.716e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.756e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.786e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 CACNB2-202ENST00000324631 3446 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.896e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SCLY-220ENST00000497951 3800 ntTSL 28.65□□□□□ -1.036e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNRPN-204ENST00000400098 525 ntTSL 48.46□□□□□ -1.066e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.066e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 TPT1-207ENST00000490277 1851 ntTSL 28.28□□□□□ -1.086e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.186e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SNRPN-206ENST00000553597 849 ntTSL 37.66□□□□□ -1.186e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 ZDHHC14-208ENST00000523468 571 ntTSL 47.56□□□□□ -1.26e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 AC124312.1-202ENST00000557230 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.62□□□□□ -1.356e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.356e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.426e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 214.4□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 NEDD4L-232ENST00000591579 144 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 NEDD4L-218ENST00000587547 889 ntTSL 1 (best)8.09□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 NEDD4L-231ENST00000590694 165 ntTSL 56.87□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 NEDD4L-212ENST00000585594 220 ntTSL 1 (best)1.81□□□□□ -2.122e-6■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.246e-10■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PABPN1-206ENST00000556809 969 ntTSL 221.43■■□□□ 1.022e-35■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 12e-35■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PACSIN2-207ENST00000422336 664 ntTSL 511.33□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PRIMPOL-209ENST00000512834 2174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PRIMPOL-205ENST00000509002 1631 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PRIMPOL-202ENST00000503752 2168 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 PRIMPOL-203ENST00000506278 1138 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 41.1
PCBP2Q15366 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 41
PCBP2Q15366 SNX13-204ENST00000444712 2018 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 41
PCBP2Q15366 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 41
PCBP2Q15366 SNX13-201ENST00000409076 3818 ntTSL 28.18□□□□□ -1.12e-9■■■■■ 41
PCBP2Q15366 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.412e-9■■■■■ 41
PCBP2Q15366 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.048e-9■■■■■ 41
PCBP2Q15366 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.048e-9■■■■■ 41
PCBP2Q15366 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 41
PCBP2Q15366 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.657e-7■■■■■ 41
PCBP2Q15366 GNG7-202ENST00000587867 723 ntTSL 58.63□□□□□ -1.035e-11■■■■■ 41
PCBP2Q15366 ZSCAN2-212ENST00000540936 579 ntTSL 419.17■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-204ENST00000358472 3231 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZSCAN2-211ENST00000540894 2914 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.811e-9■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.711e-9■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 AC068152.1-208ENST00000572864 370 ntTSL 317.86■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 AC068152.1-209ENST00000576938 372 ntTSL 514.21□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 EP400NL-204ENST00000407361 945 ntTSL 319.98■□□□□ 0.794e-11■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 EP400NL-211ENST00000539205 583 ntTSL 317.71■□□□□ 0.434e-11■■■■■ 40.9
PCBP2Q15366 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 58.45□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 AFF1-210ENST00000514970 582 ntTSL 39.27□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 AMFR-206ENST00000565445 803 ntTSL 519.23■□□□□ 0.678e-8■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 AMFR-204ENST00000563664 567 ntTSL 49.48□□□□□ -0.898e-8■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 216.77■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 218.18■□□□□ 0.58e-26■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 313.46□□□□□ -0.258e-26■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 212.49□□□□□ -0.418e-26■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 321.36■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 40.8
PCBP2Q15366 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 514.71□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 40.8
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