Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD4Q14839 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
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