Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPD1P23109 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms