Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPEP1Q9NXJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms