Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.424e-8■■■□□ 18.6
SLTMQ9NWH9 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-8■■■□□ 18.6
SLTMQ9NWH9 PFKP-212ENST00000607886 432 ntTSL 514.04□□□□□ -0.165e-7■■■□□ 18.6
SLTMQ9NWH9 PFKP-211ENST00000495715 143 ntTSL 312.66□□□□□ -0.385e-7■■■□□ 18.6
SLTMQ9NWH9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.061e-7■■■□□ 18.6
SLTMQ9NWH9 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.265e-7■■■□□ 18.6
SLTMQ9NWH9 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.011e-9■■■□□ 18.6
SLTMQ9NWH9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.434e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 223.09■■□□□ 1.294e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.644e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.51e-11■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-204ENST00000562586 578 ntTSL 216.5■□□□□ 0.231e-11■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-11■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 515.61■□□□□ 0.094e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 214.35□□□□□ -0.111e-11■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.124e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 410.71□□□□□ -0.694e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 HK1-205ENST00000436817 1042 ntTSL 515.03■□□□□ -02e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 314.58□□□□□ -0.089e-11■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 316.88■□□□□ 0.293e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 316.48■□□□□ 0.234e-8■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-8■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.134e-8■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 FASN-213ENST00000637693 100 ntTSL 59.89□□□□□ -0.834e-8■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 DNAJC6-207ENST00000494710 1621 ntTSL 525.81■■□□□ 1.728e-9■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 IDI1-203ENST00000429642 1017 ntTSL 523.61■■□□□ 1.374e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.344e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 IDI1-205ENST00000491735 1066 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.934e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 CYBRD1-204ENST00000445146 682 ntTSL 318.46■□□□□ 0.558e-9■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.548e-9■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 IDI1-204ENST00000482091 1029 ntTSL 513.86□□□□□ -0.194e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.538e-9■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 PFKFB3-218ENST00000639949 587 ntTSL 49.41□□□□□ -0.98e-9■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 MIR185-201ENST00000385288 82 ntBASIC8.96□□□□□ -0.988e-9■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 DNAJC6-204ENST00000463018 546 ntTSL 35.96□□□□□ -1.468e-9■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 515.39■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.371e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.154e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 UBA6-AS1-205ENST00000506606 2233 ntTSL 29.67□□□□□ -0.864e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 UBA6-AS1-207ENST00000514109 786 ntTSL 35.09□□□□□ -1.594e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.614e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 NUMA1-223ENST00000542977 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.31□□□□□ -0.126e-11■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 RBM12B-207ENST00000521947 452 ntTSL 311.24□□□□□ -0.615e-9■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.859e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.489e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.49e-7■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.375e-6■■■□□ 18.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.779e-7■■■□□ 18.4
SLTMQ9NWH9 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-7■■■□□ 18.4
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.591e-6■■■□□ 18.4
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.341e-6■■■□□ 18.4
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■□□ 18.4
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 18.4
SLTMQ9NWH9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.912e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.732e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 UBALD1-204ENST00000588691 281 ntTSL 324.94■■□□□ 1.582e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.422e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.282e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.232e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-212ENST00000448704 1599 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.616e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-206ENST00000418140 1372 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.346e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-208ENST00000431651 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.41□□□□□ -0.586e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-214ENST00000457939 406 ntTSL 311.06□□□□□ -0.646e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-213ENST00000451651 585 ntTSL 311.03□□□□□ -0.646e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-217ENST00000478504 552 ntTSL 410.88□□□□□ -0.676e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.76e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-205ENST00000415798 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.14□□□□□ -0.796e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 29.4□□□□□ -0.96e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 38.82□□□□□ -16e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 28.31□□□□□ -1.086e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 28.09□□□□□ -1.116e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-216ENST00000470156 569 ntTSL 1 (best)6.33□□□□□ -1.46e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-207ENST00000420441 547 ntTSL 25.52□□□□□ -1.536e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.596e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 C15orf39-206ENST00000565074 3152 ntAPPRIS ALT214.74□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.38e-7■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.693e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.154e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.114e-8■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 ZNF646-203ENST00000428260 1077 ntTSL 321.26■□□□□ 0.995e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 ZNF646-204ENST00000564189 582 ntTSL 218.15■□□□□ 0.55e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 APOC1-208ENST00000592535 430 ntTSL 1 (best)14.38□□□□□ -0.113e-11■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-11■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 APOC1-206ENST00000590334 508 ntTSL 512.55□□□□□ -0.43e-11■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 APOC1-201ENST00000586638 425 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-11■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.713e-11■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-11■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 APOC1-204ENST00000589078 213 ntTSL 210.04□□□□□ -0.83e-11■■■□□ 18.3
SLTMQ9NWH9 APOC1-207ENST00000592176 514 ntTSL 59.44□□□□□ -0.93e-11■■■□□ 18.3
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