Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-205ENST00000420990 932 ntTSL 525.63■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PIP5K1C-206ENST00000592530 456 ntTSL 525.61■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.673e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.663e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TGM2-202ENST00000373403 1018 ntTSL 325.34■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 C8orf33-205ENST00000534350 1329 ntTSL 425.28■■□□□ 1.643e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.648e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-217ENST00000635205 936 ntTSL 525.27■■□□□ 1.643e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-211ENST00000480424 2202 ntTSL 225.24■■□□□ 1.633e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.623e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DGKQ-202ENST00000502309 818 ntTSL 525.15■■□□□ 1.629e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.623e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PRELID3A-206ENST00000589565 777 ntTSL 325.11■■□□□ 1.613e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.63e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-206ENST00000446063 1262 ntTSL 1 (best)24.97■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D5-207ENST00000529281 1310 ntTSL 224.94■■□□□ 1.583e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.573e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CHMP1A-209ENST00000550872 533 ntTSL 224.76■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DRD4-202ENST00000528733 361 ntTSL 324.65■■□□□ 1.548e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.493e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.498e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.473e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PRELID3A-205ENST00000588729 529 ntTSL 424.23■■□□□ 1.473e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.442e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TGM2-206ENST00000474777 2287 ntTSL 1 (best)24.05■■□□□ 1.443e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-213ENST00000568933 170 ntTSL 324.02■■□□□ 1.443e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PTPRVP-204ENST00000639439 821 ntTSL 1 (best)23.97■■□□□ 1.433e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.418e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BAP1-208ENST00000483984 699 ntTSL 323.81■■□□□ 1.43e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.79■■□□□ 1.43e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-209ENST00000564311 870 ntTSL 523.69■■□□□ 1.383e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.353e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.333e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AC011530.1-203ENST00000597712 432 ntTSL 223.34■■□□□ 1.338e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-207ENST00000564965 578 ntTSL 423.31■■□□□ 1.323e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ELF4-203ENST00000434609 406 ntTSL 323.27■■□□□ 1.313e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.313e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 C8orf33-204ENST00000530455 2676 ntTSL 1 (best)23.18■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM63B-203ENST00000371893 2921 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.258e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-207ENST00000562690 582 ntTSL 222.73■■□□□ 1.233e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-215ENST00000592509 589 ntTSL 222.63■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CHMP1A-210ENST00000551981 689 ntTSL 222.62■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CARD9-204ENST00000481053 4060 ntTSL 222.6■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PITPNM1-211ENST00000528559 584 ntTSL 422.53■■□□□ 1.28e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BNIP3-203ENST00000631806 752 ntTSL 222.32■■□□□ 1.163e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DMPK-206ENST00000588522 2920 ntTSL 522.21■■□□□ 1.158e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TGM2-204ENST00000468262 1862 ntTSL 1 (best)22.04■■□□□ 1.123e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 GAK-213ENST00000510799 763 ntTSL 1 (best)21.97■■□□□ 1.113e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.093e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-212ENST00000484523 582 ntTSL 521.85■■□□□ 1.093e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-211ENST00000498109 563 ntTSL 221.79■■□□□ 1.083e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.053e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM63B-209ENST00000533121 2465 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.058e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.043e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WDR1-216ENST00000514319 719 ntTSL 521.35■■□□□ 1.013e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CARD9-205ENST00000485975 4574 ntTSL 221.34■■□□□ 1.013e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AC011530.1-202ENST00000596586 397 ntAPPRIS P5 TSL 221.12■□□□□ 0.978e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AC011530.1-204ENST00000595946 321 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.12■□□□□ 0.978e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.963e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.948e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.933e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.933e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TGM2-203ENST00000453095 693 ntTSL 420.52■□□□□ 0.883e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.873e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NUDT14-204ENST00000550002 456 ntTSL 320.38■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.858e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-208ENST00000461200 3325 ntTSL 220.33■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-213ENST00000540241 608 ntTSL 320.06■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 219.78■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-215ENST00000438141 1743 ntTSL 219.65■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-205ENST00000525079 768 ntTSL 319.61■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.728e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DGKQ-203ENST00000509465 4362 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.49■□□□□ 0.719e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 219.45■□□□□ 0.73e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.73e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SYMPK-210ENST00000598329 1000 ntTSL 319.39■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 519.32■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 519.19■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 26.4
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