Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APRG1Q8IVJ8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APRG1Q8IVJ8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms