Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms