Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q1T7F1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q1T7F1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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