Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF11Q15544 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF11Q15544 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms