Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms