Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A6NDN8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
A6NDN8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NDN8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NDN8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NDN8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms