Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPHS2Q9NP85 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323.7 ms