Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 41.8
PUM2Q8TB72 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.212e-25■■■■■ 41.7
PUM2Q8TB72 ARMCX3-201ENST00000341189 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-25■■■■■ 41.7
PUM2Q8TB72 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.122e-25■■■■■ 41.7
PUM2Q8TB72 SLC25A44-201ENST00000359511 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 41.7
PUM2Q8TB72 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.893e-9■■■■■ 41.7
PUM2Q8TB72 SLC25A44-204ENST00000469537 6952 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 41.7
PUM2Q8TB72 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.848e-9■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.258e-9■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.616e-8■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 AHCTF1-203ENST00000470300 7041 ntTSL 1 (best)1.54□□□□□ -2.166e-8■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.449e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.569e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.629e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ITPR1-217ENST00000493491 1793 ntTSL 214.88□□□□□ -0.038e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ITPR1-206ENST00000463980 2215 ntTSL 211.77□□□□□ -0.538e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ITPR1-219ENST00000544951 4131 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.688e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.28e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.28e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.218e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.228e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.268e-10■■■■■ 41.6
PUM2Q8TB72 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 212.21□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RABGEF1-208ENST00000510829 3553 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RABGEF1-205ENST00000450873 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-25■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NUP133-204ENST00000490352 643 ntTSL 27.29□□□□□ -1.242e-25■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 C15orf61-204ENST00000560547 461 ntTSL 220.47■□□□□ 0.873e-17■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RHBDD2-204ENST00000454791 1831 ntTSL 224.17■■□□□ 1.466e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.396e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 PPFIA3-212ENST00000602897 1615 ntTSL 221.34■■□□□ 1.012e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 PPFIA3-211ENST00000602848 1638 ntTSL 1 (best)21.34■■□□□ 1.012e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.886e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 PPFIA3-209ENST00000602783 980 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.672e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.326e-18■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.673e-11■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-11■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.93e-11■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 09e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.779e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NEDD4-209ENST00000508871 5707 ntTSL 1 (best)3.92□□□□□ -1.789e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NEDD4-204ENST00000503468 6339 ntTSL 1 (best)2.91□□□□□ -1.949e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.969e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.079e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.961e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NOL11-206ENST00000581375 2448 ntTSL 27.39□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NOL11-204ENST00000580914 654 ntTSL 27.02□□□□□ -1.291e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 NOL11-203ENST00000580833 815 ntTSL 54.39□□□□□ -1.711e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.325e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 C21orf91-OT1-201ENST00000430401 432 ntTSL 1 (best)4.94□□□□□ -1.625e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.695e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.765e-9■■■■■ 41.5
PUM2Q8TB72 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-18■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 RHBDD1-202ENST00000392062 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.962e-18■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 RHBDD1-214ENST00000493526 1003 ntTSL 38.27□□□□□ -1.092e-18■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 RHBDD1-213ENST00000491490 801 ntTSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.242e-18■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 RHBDD1-212ENST00000483268 472 ntTSL 47.2□□□□□ -1.262e-18■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 ESRRB-208ENST00000611036 2190 nt13.64□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.064e-11■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 41.4
PUM2Q8TB72 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.031e-7■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.841e-7■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 YY1-204ENST00000554579 826 ntTSL 26.79□□□□□ -1.322e-14■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.022e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 PYCR2-206ENST00000478402 3149 ntTSL 213.96□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.375e-19■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 CD59-213ENST00000533403 1847 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 CD59-202ENST00000395850 1889 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 CD59-203ENST00000415002 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 CD59-211ENST00000528987 3716 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.492e-10■■■■■ 41.3
PUM2Q8TB72 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 41.2
PUM2Q8TB72 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 41.2
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