RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602848.5

PPFIA3-211, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PPFIA3, Length 1,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-211ENST00000602848 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.36■■■■■ 5.65
PPFIA3-211ENST00000602848 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.97■■■■■ 4.63
PPFIA3-211ENST00000602848 ABCC9O60706 1549 aa42.44■■■■■ 4.38
PPFIA3-211ENST00000602848 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
PPFIA3-211ENST00000602848 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.77■■■■■ 4.28
PPFIA3-211ENST00000602848 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.42■■■■■ 4.22
PPFIA3-211ENST00000602848 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.31■■■■■ 4.2
PPFIA3-211ENST00000602848 NACADO15069 1562 aa41.06■■■■■ 4.16
PPFIA3-211ENST00000602848 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.99■■■■■ 4.15
PPFIA3-211ENST00000602848 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.86■■■■■ 4.13
PPFIA3-211ENST00000602848 SCRIBQ14160 1630 aa40.24■■■■■ 4.03
PPFIA3-211ENST00000602848 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.18■■■■■ 4.02
PPFIA3-211ENST00000602848 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.84■■■■□ 3.97
PPFIA3-211ENST00000602848 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.72■■■■□ 3.955e-6■■■■□ 22.2
PPFIA3-211ENST00000602848 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
PPFIA3-211ENST00000602848 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
PPFIA3-211ENST00000602848 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.02■■■■□ 3.84
PPFIA3-211ENST00000602848 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
PPFIA3-211ENST00000602848 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.83■■■■□ 3.81
PPFIA3-211ENST00000602848 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
PPFIA3-211ENST00000602848 SMARCA4P51532 1647 aa38.67■■■■□ 3.78
PPFIA3-211ENST00000602848 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.63■■■■□ 3.78
PPFIA3-211ENST00000602848 WIZO95785 1651 aa38.49■■■■□ 3.75
PPFIA3-211ENST00000602848 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.43■■■■□ 3.74
PPFIA3-211ENST00000602848 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.29■■■■□ 3.72
PPFIA3-211ENST00000602848 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
PPFIA3-211ENST00000602848 SMARCA2P51531 1590 aa38.09■■■■□ 3.69
PPFIA3-211ENST00000602848 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.05■■■■□ 3.68
PPFIA3-211ENST00000602848 NCAPD3P42695 1498 aa37.91■■■■□ 3.66
PPFIA3-211ENST00000602848 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.84■■■■□ 3.65
PPFIA3-211ENST00000602848 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
PPFIA3-211ENST00000602848 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.76■■■■□ 3.64
PPFIA3-211ENST00000602848 HMGXB3Q12766 1538 aa37.76■■■■□ 3.64
PPFIA3-211ENST00000602848 TRIM41Q8WV44 630 aa37.18■■■■□ 3.54
PPFIA3-211ENST00000602848 CFTRP13569 1480 aa36.92■■■■□ 3.5
PPFIA3-211ENST00000602848 NESP48681 1621 aa36.89■■■■□ 3.5
PPFIA3-211ENST00000602848 ABCC8Q09428 1581 aa36.87■■■■□ 3.49
PPFIA3-211ENST00000602848 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.81■■■■□ 3.48
PPFIA3-211ENST00000602848 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.79■■■■□ 3.48
PPFIA3-211ENST00000602848 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.77■■■■□ 3.48
PPFIA3-211ENST00000602848 PRDM2Q13029 1718 aa36.73■■■■□ 3.47
PPFIA3-211ENST00000602848 SYNJ1O43426 1573 aa36.53■■■■□ 3.44
PPFIA3-211ENST00000602848 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.51■■■■□ 3.43
PPFIA3-211ENST00000602848 TOP2BQ02880 1626 aa36.48■■■■□ 3.43
PPFIA3-211ENST00000602848 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.47■■■■□ 3.43
PPFIA3-211ENST00000602848 ERCC6Q03468 1493 aa36.47■■■■□ 3.43
PPFIA3-211ENST00000602848 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.45■■■■□ 3.43
PPFIA3-211ENST00000602848 EEA1Q15075 1411 aa36.4■■■■□ 3.42
PPFIA3-211ENST00000602848 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.38■■■■□ 3.41
PPFIA3-211ENST00000602848 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
PPFIA3-211ENST00000602848 CUX1P39880 1505 aa36.32■■■■□ 3.4
PPFIA3-211ENST00000602848 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.28■■■■□ 3.4
PPFIA3-211ENST00000602848 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.27■■■■□ 3.4
PPFIA3-211ENST00000602848 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
PPFIA3-211ENST00000602848 SOGA1O94964 1423 aa36.23■■■■□ 3.39
PPFIA3-211ENST00000602848 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.15■■■■□ 3.38
PPFIA3-211ENST00000602848 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.1■■■■□ 3.37
PPFIA3-211ENST00000602848 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.05■■■■□ 3.36
PPFIA3-211ENST00000602848 WDR62O43379 1518 aa36.05■■■■□ 3.36
PPFIA3-211ENST00000602848 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.05■■■■□ 3.36
PPFIA3-211ENST00000602848 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
PPFIA3-211ENST00000602848 CUX2O14529 1486 aa35.97■■■■□ 3.35
PPFIA3-211ENST00000602848 TOPBP1Q92547 1522 aa35.94■■■■□ 3.34
PPFIA3-211ENST00000602848 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.93■■■■□ 3.34
PPFIA3-211ENST00000602848 KIF27Q86VH2 1401 aa35.88■■■■□ 3.33
PPFIA3-211ENST00000602848 KIF21BO75037 1637 aa35.82■■■■□ 3.33
PPFIA3-211ENST00000602848 GOLGA3Q08378 1498 aa35.79■■■■□ 3.32
PPFIA3-211ENST00000602848 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
PPFIA3-211ENST00000602848 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.72■■■■□ 3.31
PPFIA3-211ENST00000602848 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.68■■■■□ 3.3
PPFIA3-211ENST00000602848 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.68■■■■□ 3.3
PPFIA3-211ENST00000602848 PRXQ9BXM0 1461 aa35.63■■■■□ 3.29
PPFIA3-211ENST00000602848 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.61■■■■□ 3.29
PPFIA3-211ENST00000602848 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.57■■■■□ 3.29
PPFIA3-211ENST00000602848 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
PPFIA3-211ENST00000602848 IGF1RP08069 1367 aa35.53■■■■□ 3.28
PPFIA3-211ENST00000602848 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.51■■■■□ 3.27
PPFIA3-211ENST00000602848 IFT140Q96RY7 1462 aa35.5■■■■□ 3.27
PPFIA3-211ENST00000602848 WDR97A6NE52 1622 aa35.5■■■■□ 3.27
PPFIA3-211ENST00000602848 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
PPFIA3-211ENST00000602848 CEP162Q5TB80 1403 aa35.43■■■■□ 3.26
PPFIA3-211ENST00000602848 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
PPFIA3-211ENST00000602848 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.35■■■■□ 3.25
PPFIA3-211ENST00000602848 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.34■■■■□ 3.25
PPFIA3-211ENST00000602848 CUL7Q14999 1698 aa35.29■■■■□ 3.24
PPFIA3-211ENST00000602848 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.28■■■■□ 3.24
PPFIA3-211ENST00000602848 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
PPFIA3-211ENST00000602848 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PPFIA3-211ENST00000602848 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.19■■■■□ 3.22
PPFIA3-211ENST00000602848 CLIP1P30622 1438 aa35.18■■■■□ 3.22
PPFIA3-211ENST00000602848 GRIN2BQ13224 1484 aa35.04■■■■□ 3.2
PPFIA3-211ENST00000602848 PBRM1Q86U86 1689 aa35.03■■■■□ 3.2
PPFIA3-211ENST00000602848 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.95■■■■□ 3.18
PPFIA3-211ENST00000602848 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.9■■■■□ 3.18
PPFIA3-211ENST00000602848 ADAMTS12P58397 1594 aa34.87■■■■□ 3.17
PPFIA3-211ENST00000602848 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.87■■■■□ 3.17
PPFIA3-211ENST00000602848 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.84■■■■□ 3.17
PPFIA3-211ENST00000602848 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
PPFIA3-211ENST00000602848 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
PPFIA3-211ENST00000602848 ARAP1Q96P48 1450 aa34.79■■■■□ 3.16
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