Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP35Q8NFH5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms