Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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NDUFA9Q16795 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NDUFA9Q16795 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NDUFA9Q16795 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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NDUFA9Q16795 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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