Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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