Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASQ1P31415 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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