Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 KPNA2-206ENST00000583392 507 ntTSL 22.16□□□□□ -2.061e-9■■■■■ 30.5
RPS3P23396 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.175e-13■■■■■ 30.5
RPS3P23396 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.495e-13■■■■■ 30.5
RPS3P23396 SNRPD2-207ENST00000588599 805 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.665e-13■■■■■ 30.5
RPS3P23396 SNRPD2-204ENST00000587367 596 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.75e-13■■■■■ 30.5
RPS3P23396 SNRPD2-202ENST00000391932 615 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.825e-13■■■■■ 30.5
RPS3P23396 SNRPD2-201ENST00000342669 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.875e-13■■■■■ 30.5
RPS3P23396 SNRPD2-208ENST00000590212 454 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.965e-13■■■■■ 30.5
RPS3P23396 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.267e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 HAT1-206ENST00000494601 3845 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 30.4
RPS3P23396 HAT1-204ENST00000457761 1642 ntTSL 1 (best)9.22□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 30.4
RPS3P23396 HAT1-203ENST00000412731 1567 ntTSL 1 (best)7.69□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 30.4
RPS3P23396 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.637e-7■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 FDFT1-217ENST00000530337 741 ntTSL 316.82■□□□□ 0.288e-10■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RPS27A-205ENST00000463185 590 ntTSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.793e-19■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RPS27A-209ENST00000494756 535 ntTSL 29.75□□□□□ -0.853e-19■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RPS27A-207ENST00000471772 557 ntTSL 27.83□□□□□ -1.163e-19■■■■■ 30.4
RPS3P23396 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.353e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 NAT14-205ENST00000592719 545 ntTSL 514.85□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 TP53RK-202ENST00000372114 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC11.94□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RDH11-207ENST00000554731 888 ntTSL 311.88□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 PTPN23-206ENST00000602307 5119 ntTSL 211.49□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MICU1-205ENST00000476605 1933 ntTSL 210.13□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RDH11-202ENST00000428130 1064 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 PRPF8-203ENST00000571958 380 ntTSL 39.48□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RDH11-206ENST00000554035 849 ntTSL 38.88□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ADAR-205ENST00000492630 612 ntTSL 28.69□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.293e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MANF-203ENST00000482262 436 ntTSL 24.8□□□□□ -1.643e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 AL049779.1-202ENST00000553582 498 ntTSL 24.31□□□□□ -1.723e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RDH11-204ENST00000553578 4035 ntTSL 1 (best)3.84□□□□□ -1.83e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.93e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 AL049779.1-203ENST00000554493 364 ntTSL 23.02□□□□□ -1.933e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 AL049779.1-204ENST00000557564 274 ntAPPRIS P1 TSL 2-2.68□□□□□ -2.843e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.398e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 220.33■□□□□ 0.858e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.798e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.658e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 518.07■□□□□ 0.488e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 517.61■□□□□ 0.418e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.258e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 SLCO4A1-206ENST00000470412 986 ntTSL 511□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 30.4
RPS3P23396 EIF4A1-208ENST00000578476 573 ntTSL 216.35■□□□□ 0.213e-12■■■■■ 30.4
RPS3P23396 CLTC-203ENST00000466513 793 ntTSL 21.81□□□□□ -2.122e-10■■■■■ 30.4
RPS3P23396 PMPCA-204ENST00000444897 2316 ntTSL 215.91■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 DCAF13-205ENST00000521971 2049 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 DCAF13-203ENST00000519682 837 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -11e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.928e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 HPRT1-203ENST00000475720 599 ntTSL 34.74□□□□□ -1.658e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.53e-14■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-14■■■■■ 30.4
RPS3P23396 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-14■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.134e-26■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MIF-202ENST00000465752 589 ntTSL 1 (best)16.4■□□□□ 0.224e-26■■■■■ 30.4
RPS3P23396 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.114e-26■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MARCH7-204ENST00000420397 983 ntTSL 51.55□□□□□ -2.164e-7■■■■■ 30.4
RPS3P23396 MARCH7-208ENST00000478396 797 ntTSL 50.53□□□□□ -2.324e-7■■■■■ 30.4
RPS3P23396 CMBL-207ENST00000514202 593 ntTSL 212.58□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 30.4
RPS3P23396 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.925e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.895e-8■■■■■ 30.4
RPS3P23396 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 30.4
RPS3P23396 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -04e-9■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CSNK2B-206ENST00000468255 1792 ntTSL 514.78□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 30.3
RPS3P23396 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 314.36□□□□□ -0.111e-16■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 30.3
RPS3P23396 AL662899.3-202ENST00000617558 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.564e-9■■■■■ 30.3
RPS3P23396 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.624e-9■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 211.03□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CSNK2B-204ENST00000375885 1061 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.164e-9■■■■■ 30.3
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