Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NPM2Q86SE8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms