Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9C1Q4G0N8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9C1Q4G0N8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9C1Q4G0N8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9C1Q4G0N8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9C1Q4G0N8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC9C1Q4G0N8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9C1Q4G0N8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9C1Q4G0N8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms