Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.241e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.333e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 MGEA5-204ENST00000429860 769 ntTSL 36.25□□□□□ -1.413e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 MPP1-216ENST00000491955 2378 ntTSL 25.47□□□□□ -1.533e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 PPP2R5A-202ENST00000479259 740 ntTSL 55.37□□□□□ -1.553e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 PPP2R5A-204ENST00000498129 745 ntTSL 55.27□□□□□ -1.573e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 PCM1-215ENST00000522275 2379 ntTSL 24.2□□□□□ -1.741e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.973e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.071e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 26.91□□□□□ -1.33e-10■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-11■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 HGD-210ENST00000494453 683 ntTSL 37.16□□□□□ -1.262e-11■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 HGD-204ENST00000475447 565 ntTSL 36.97□□□□□ -1.292e-11■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 HGD-209ENST00000492108 631 ntTSL 25.99□□□□□ -1.452e-11■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 INSIG2-206ENST00000485520 3185 ntTSL 59.21□□□□□ -0.934e-11■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 INSIG2-204ENST00000471186 2100 ntTSL 57.76□□□□□ -1.174e-11■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.242e-11■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.354e-11■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 24.89□□□□□ -1.634e-17■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 UBC-210ENST00000541645 548 ntTSL 214.4□□□□□ -0.11e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 UBC-203ENST00000535859 582 ntTSL 211.56□□□□□ -0.561e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 UBC-212ENST00000544481 477 ntTSL 49.91□□□□□ -0.821e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 UBC-207ENST00000540351 622 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.831e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 UBC-202ENST00000535131 563 ntTSL 59.75□□□□□ -0.851e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 UBC-214ENST00000546271 559 ntTSL 49.4□□□□□ -0.91e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 UBC-209ENST00000541272 582 ntTSL 59.01□□□□□ -0.971e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 07e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.187e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 DCAF12-201ENST00000361264 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.982e-8■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 316.26■□□□□ 0.193e-6■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 415.27■□□□□ 0.043e-6■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.123e-6■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 412.97□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.663e-6■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.463e-6■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 514.63□□□□□ -0.072e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 213.05□□□□□ -0.322e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.324e-18■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.344e-18■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 312.49□□□□□ -0.414e-18■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-18■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 FMO5-209ENST00000619062 1842 ntTSL 29.75□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.292e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.352e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 FMO5-206ENST00000533174 671 ntTSL 45.02□□□□□ -1.612e-7■■□□□ 11.5
SRSF7Q16629 SRRM1-221ENST00000593639 563 ntTSL 57.13□□□□□ -1.273e-6■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 26.22□□□□□ -1.412e-18■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.841e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.911e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.011e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 28.48□□□□□ -1.051e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.071e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.121e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.121e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.231e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 56.67□□□□□ -1.341e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.461e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.921e-12■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 LUC7L3-212ENST00000508045 1112 ntTSL 1 (best)11.88□□□□□ -0.512e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 LUC7L3-206ENST00000504563 840 ntTSL 511.27□□□□□ -0.612e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 LUC7L3-210ENST00000507200 510 ntTSL 45.39□□□□□ -1.552e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 LUC7L3-211ENST00000507503 561 ntTSL 24.46□□□□□ -1.72e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 LUC7L3-218ENST00000511068 277 ntTSL 23.17□□□□□ -1.92e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.593e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.653e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 STRIP2-203ENST00000465033 587 ntTSL 37.72□□□□□ -1.173e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SNHG12-204ENST00000464612 719 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.263e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 315.45■□□□□ 0.062e-11■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-209ENST00000554947 1203 ntTSL 219.53■□□□□ 0.722e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-216ENST00000556175 775 ntTSL 316.61■□□□□ 0.252e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-218ENST00000556262 1960 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-203ENST00000544691 1507 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.072e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-220ENST00000556548 2336 ntTSL 215.44■□□□□ 0.062e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.252e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 SDR39U1-215ENST00000555830 418 ntTSL 312.38□□□□□ -0.432e-7■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.072e-8■■□□□ 11.4
SRSF7Q16629 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DCAF13-208ENST00000612750 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.041e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 HNRNPC-220ENST00000555585 682 ntTSL 28.06□□□□□ -1.126e-13■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DCAF13-202ENST00000518554 5300 ntTSL 26.22□□□□□ -1.411e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DCAF13-207ENST00000611541 3496 nt3.57□□□□□ -1.841e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 MORF4L2-213ENST00000488331 326 ntTSL 26.11□□□□□ -1.435e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DDX39B-219ENST00000481456 5158 ntTSL 29.81□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DDX39B-210ENST00000431908 914 ntTSL 59.17□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.981e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-6■□□□□ 11.3
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