Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms