Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-27■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.263e-27■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.313e-27■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.413e-27■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)6.09□□□□□ -1.443e-27■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.975e-7■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 ANKS6-205ENST00000471846 1103 ntTSL 226.28■■□□□ 1.87e-24■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 ANKMY1-223ENST00000489677 292 ntTSL 59.44□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 NAXD-203ENST00000470164 2377 ntTSL 218.82■□□□□ 0.69e-10■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.59e-10■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.289e-10■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.969e-10■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.062e-9■■■■■ 35.1
GTF2F1P35269 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.982e-9■■■■■ 35.1
GTF2F1P35269 HMGCR-208ENST00000509431 421 ntTSL 216.23■□□□□ 0.191e-11■■■■■ 35.1
GTF2F1P35269 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-11■■■■■ 35.1
GTF2F1P35269 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.031e-11■■■■■ 35.1
GTF2F1P35269 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.051e-11■■■■■ 35.1
GTF2F1P35269 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.314e-7■■■■■ 35.1
GTF2F1P35269 SLC19A1-210ENST00000486303 708 ntTSL 223.04■■□□□ 1.287e-7■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 326.79■■□□□ 1.882e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PPP1CB-205ENST00000420282 570 ntTSL 423.06■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PPP1CB-206ENST00000427786 569 ntTSL 421.81■■□□□ 1.082e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PPP1CB-207ENST00000441461 584 ntTSL 216.44■□□□□ 0.222e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 214.87□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 PDXK-213ENST00000472777 460 ntTSL 511.68□□□□□ -0.549e-9■■■■■ 35
GTF2F1P35269 CHST15-203ENST00000462406 826 ntTSL 29.35□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 35
GTF2F1P35269 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 219.92■□□□□ 0.786e-9■■■■■ 35
GTF2F1P35269 LAMA5-209ENST00000481120 386 ntTSL 225.1■■□□□ 1.611e-10■■■■■ 35
GTF2F1P35269 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 25e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.595e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.515e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 TSPAN4-219ENST00000530404 818 ntTSL 523.64■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.275e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 320.41■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 IMPDH1-209ENST00000473463 590 ntTSL 221.79■■□□□ 1.084e-16■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 IMPDH1-213ENST00000491376 748 ntTSL 421.79■■□□□ 1.084e-16■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 RAB4B-EGLN2-203ENST00000601949 482 ntTSL 420.63■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 IMPDH1-216ENST00000497868 952 ntTSL 518.68■□□□□ 0.584e-16■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 DAP-203ENST00000508253 785 ntTSL 216.82■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 IMPDH1-212ENST00000489263 598 ntTSL 316.81■□□□□ 0.284e-16■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-13■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-13■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 DDX56-203ENST00000421223 3028 ntTSL 212.45□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-219ENST00000630986 588 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 DAP-206ENST00000514882 562 ntTSL 411.21□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-215ENST00000629314 417 ntTSL 57.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-216ENST00000630010 575 ntTSL 57.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 ZNF581-202ENST00000585995 591 ntTSL 320.99■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 CCDC106-208ENST00000592996 741 ntTSL 320.82■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 CHTF18-215ENST00000564940 197 ntTSL 218.58■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.089e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.949e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-208ENST00000520872 560 ntTSL 321.03■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-204ENST00000518767 1146 ntTSL 1 (best)16.51■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-203ENST00000518502 687 ntTSL 313.8□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-228ENST00000524191 808 ntTSL 313.73□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-202ENST00000517542 1695 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-216ENST00000521736 550 ntTSL 59.32□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -14e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-218ENST00000522061 564 ntTSL 48.37□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-213ENST00000521447 727 ntTSL 57.08□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-205ENST00000518981 1746 ntTSL 27.01□□□□□ -1.294e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-206ENST00000519818 590 ntTSL 46.52□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-227ENST00000524113 658 ntTSL 26.52□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-223ENST00000523160 227 ntTSL 36.4□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-217ENST00000521845 546 ntTSL 55.93□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-211ENST00000521293 552 ntTSL 45.35□□□□□ -1.554e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.564e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-209ENST00000520945 472 ntTSL 44.8□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.84e-7■■■■■ 34.9
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.453e-8■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.664e-10■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 CYP4V2-203ENST00000507209 8646 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.234e-10■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.321e-9■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 TOB1-203ENST00000509385 889 ntTSL 216.61■□□□□ 0.251e-9■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 TOB1-201ENST00000268957 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 29.43□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 34.8
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 108.4 ms