Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms