Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX6O95503 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX6O95503 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX6O95503 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX6O95503 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX6O95503 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX6O95503 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CBX6O95503 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CBX6O95503 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CBX6O95503 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX6O95503 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX6O95503 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms