Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms