Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KANK3Q6NY19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KANK3Q6NY19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms