Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms