Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL2Q08999 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL2Q08999 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms