Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB2Q00653 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.2 ms