Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB15P59190 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB15P59190 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB15P59190 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB15P59190 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB15P59190 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB15P59190 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB15P59190 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB15P59190 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB15P59190 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB15P59190 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB15P59190 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB15P59190 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB15P59190 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB15P59190 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB15P59190 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB15P59190 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB15P59190 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB15P59190 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB15P59190 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB15P59190 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms