Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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