RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.22■■■□□ 2.43
CITED1-206ENST00000431381 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.56■■□□□ 1.84
CITED1-206ENST00000431381 ABCC9O60706 1549 aa25.41■■□□□ 1.66
CITED1-206ENST00000431381 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CITED1-206ENST00000431381 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.2■■□□□ 1.62
CITED1-206ENST00000431381 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.98■■□□□ 1.59
CITED1-206ENST00000431381 NACADO15069 1562 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-206ENST00000431381 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED1-206ENST00000431381 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.71■■□□□ 1.55
CITED1-206ENST00000431381 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED1-206ENST00000431381 SCRIBQ14160 1630 aa24.39■■□□□ 1.49
CITED1-206ENST00000431381 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-206ENST00000431381 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
CITED1-206ENST00000431381 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.86■■□□□ 1.41
CITED1-206ENST00000431381 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.48■■□□□ 1.35
CITED1-206ENST00000431381 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CITED1-206ENST00000431381 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CITED1-206ENST00000431381 SMARCA4P51532 1647 aa23.33■■□□□ 1.32
CITED1-206ENST00000431381 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.32■■□□□ 1.32
CITED1-206ENST00000431381 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CITED1-206ENST00000431381 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CITED1-206ENST00000431381 WIZO95785 1651 aa23.15■■□□□ 1.3
CITED1-206ENST00000431381 SMARCA2P51531 1590 aa23.05■■□□□ 1.28
CITED1-206ENST00000431381 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.01■■□□□ 1.27
CITED1-206ENST00000431381 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23■■□□□ 1.27
CITED1-206ENST00000431381 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.97■■□□□ 1.27
CITED1-206ENST00000431381 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CITED1-206ENST00000431381 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CITED1-206ENST00000431381 NCAPD3P42695 1498 aa22.85■■□□□ 1.25
CITED1-206ENST00000431381 HMGXB3Q12766 1538 aa22.82■■□□□ 1.24
CITED1-206ENST00000431381 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.64■■□□□ 1.21
CITED1-206ENST00000431381 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.59■■□□□ 1.21
CITED1-206ENST00000431381 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.27■■□□□ 1.16
CITED1-206ENST00000431381 CFTRP13569 1480 aa22.26■■□□□ 1.15
CITED1-206ENST00000431381 PRDM2Q13029 1718 aa22.21■■□□□ 1.15
CITED1-206ENST00000431381 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.19■■□□□ 1.14
CITED1-206ENST00000431381 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.17■■□□□ 1.14
CITED1-206ENST00000431381 NESP48681 1621 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-206ENST00000431381 ABCC8Q09428 1581 aa22.08■■□□□ 1.12
CITED1-206ENST00000431381 TRIM41Q8WV44 630 aa22.06■■□□□ 1.12
CITED1-206ENST00000431381 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.05■■□□□ 1.12
CITED1-206ENST00000431381 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED1-206ENST00000431381 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
CITED1-206ENST00000431381 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.97■■□□□ 1.11
CITED1-206ENST00000431381 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.94■■□□□ 1.1
CITED1-206ENST00000431381 ERCC6Q03468 1493 aa21.9■■□□□ 1.1
CITED1-206ENST00000431381 SYNJ1O43426 1573 aa21.88■■□□□ 1.09
CITED1-206ENST00000431381 CUX1P39880 1505 aa21.85■■□□□ 1.09
CITED1-206ENST00000431381 TOP2BQ02880 1626 aa21.84■■□□□ 1.09
CITED1-206ENST00000431381 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.84■■□□□ 1.09
CITED1-206ENST00000431381 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.8■■□□□ 1.08
CITED1-206ENST00000431381 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.77■■□□□ 1.07
CITED1-206ENST00000431381 TOPBP1Q92547 1522 aa21.75■■□□□ 1.07
CITED1-206ENST00000431381 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CITED1-206ENST00000431381 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.69■■□□□ 1.06
CITED1-206ENST00000431381 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CITED1-206ENST00000431381 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CITED1-206ENST00000431381 WDR62O43379 1518 aa21.63■■□□□ 1.05
CITED1-206ENST00000431381 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CITED1-206ENST00000431381 SOGA1O94964 1423 aa21.57■■□□□ 1.04
CITED1-206ENST00000431381 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED1-206ENST00000431381 EEA1Q15075 1411 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED1-206ENST00000431381 CUX2O14529 1486 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED1-206ENST00000431381 KIF27Q86VH2 1401 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED1-206ENST00000431381 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.49■■□□□ 1.03
CITED1-206ENST00000431381 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED1-206ENST00000431381 IFT140Q96RY7 1462 aa21.45■■□□□ 1.03
CITED1-206ENST00000431381 WDR97A6NE52 1622 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED1-206ENST00000431381 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.43■■□□□ 1.02
CITED1-206ENST00000431381 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CITED1-206ENST00000431381 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.38■■□□□ 1.01
CITED1-206ENST00000431381 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CITED1-206ENST00000431381 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.33■■□□□ 1.01
CITED1-206ENST00000431381 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.32■■□□□ 1
CITED1-206ENST00000431381 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.31■■□□□ 1
CITED1-206ENST00000431381 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CITED1-206ENST00000431381 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
CITED1-206ENST00000431381 IGF1RP08069 1367 aa21.26■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 PBRM1Q86U86 1689 aa21.26■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 KIF21BO75037 1637 aa21.25■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 GOLGA3Q08378 1498 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 GRIN2BQ13224 1484 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 CUL7Q14999 1698 aa21.21■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.21■□□□□ 0.99
CITED1-206ENST00000431381 PRXQ9BXM0 1461 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED1-206ENST00000431381 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.16■□□□□ 0.98
CITED1-206ENST00000431381 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.12■□□□□ 0.97
CITED1-206ENST00000431381 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.1■□□□□ 0.97
CITED1-206ENST00000431381 ADAMTS12P58397 1594 aa21.09■□□□□ 0.97
CITED1-206ENST00000431381 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CITED1-206ENST00000431381 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.06■□□□□ 0.96
CITED1-206ENST00000431381 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CITED1-206ENST00000431381 FBLN2P98095 1184 aa21.02■□□□□ 0.96
CITED1-206ENST00000431381 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CITED1-206ENST00000431381 SYNJ2O15056 1496 aa20.99■□□□□ 0.95
CITED1-206ENST00000431381 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CITED1-206ENST00000431381 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms