Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CTF2P-201ENST00000412003 604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 OR10AA1P-201ENST00000417823 937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ZBED3-AS1-206ENST00000508401 582 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms