RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.31■■■□□ 2.44
CNMD-201ENST00000377962 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.87■■□□□ 1.89
CNMD-201ENST00000377962 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CNMD-201ENST00000377962 ABCC9O60706 1549 aa26.32■■□□□ 1.8
CNMD-201ENST00000377962 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.57■■□□□ 1.68
CNMD-201ENST00000377962 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.39■■□□□ 1.66
CNMD-201ENST00000377962 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.26■■□□□ 1.63
CNMD-201ENST00000377962 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CNMD-201ENST00000377962 NACADO15069 1562 aa25.24■■□□□ 1.63
CNMD-201ENST00000377962 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.05■■□□□ 1.6
CNMD-201ENST00000377962 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25■■□□□ 1.59
CNMD-201ENST00000377962 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.81■■□□□ 1.56
CNMD-201ENST00000377962 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
CNMD-201ENST00000377962 SCRIBQ14160 1630 aa24.63■■□□□ 1.53
CNMD-201ENST00000377962 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.57■■□□□ 1.52
CNMD-201ENST00000377962 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.16■■□□□ 1.46
CNMD-201ENST00000377962 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.14■■□□□ 1.45
CNMD-201ENST00000377962 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CNMD-201ENST00000377962 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.8■■□□□ 1.4
CNMD-201ENST00000377962 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.68■■□□□ 1.38
CNMD-201ENST00000377962 SMARCA4P51532 1647 aa23.51■■□□□ 1.35
CNMD-201ENST00000377962 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
CNMD-201ENST00000377962 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.42■■□□□ 1.34
CNMD-201ENST00000377962 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.36■■□□□ 1.33
CNMD-201ENST00000377962 NCAPD3P42695 1498 aa23.3■■□□□ 1.32
CNMD-201ENST00000377962 SMARCA2P51531 1590 aa23.29■■□□□ 1.32
CNMD-201ENST00000377962 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.22■■□□□ 1.31
CNMD-201ENST00000377962 WIZO95785 1651 aa23.2■■□□□ 1.3
CNMD-201ENST00000377962 HMGXB3Q12766 1538 aa23.17■■□□□ 1.3
CNMD-201ENST00000377962 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CNMD-201ENST00000377962 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CNMD-201ENST00000377962 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CNMD-201ENST00000377962 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CNMD-201ENST00000377962 NESP48681 1621 aa22.83■■□□□ 1.25
CNMD-201ENST00000377962 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CNMD-201ENST00000377962 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.66■■□□□ 1.22
CNMD-201ENST00000377962 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.64■■□□□ 1.22
CNMD-201ENST00000377962 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.64■■□□□ 1.21
CNMD-201ENST00000377962 ERCC6Q03468 1493 aa22.63■■□□□ 1.21
CNMD-201ENST00000377962 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CNMD-201ENST00000377962 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.55■■□□□ 1.2
CNMD-201ENST00000377962 CFTRP13569 1480 aa22.51■■□□□ 1.19
CNMD-201ENST00000377962 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.5■■□□□ 1.19
CNMD-201ENST00000377962 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CNMD-201ENST00000377962 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.4■■□□□ 1.18
CNMD-201ENST00000377962 PRDM2Q13029 1718 aa22.38■■□□□ 1.17
CNMD-201ENST00000377962 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.34■■□□□ 1.17
CNMD-201ENST00000377962 CUX2O14529 1486 aa22.31■■□□□ 1.16
CNMD-201ENST00000377962 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.3■■□□□ 1.16
CNMD-201ENST00000377962 WDR62O43379 1518 aa22.22■■□□□ 1.15
CNMD-201ENST00000377962 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CNMD-201ENST00000377962 TOPBP1Q92547 1522 aa22.07■■□□□ 1.12
CNMD-201ENST00000377962 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.02■■□□□ 1.12
CNMD-201ENST00000377962 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.99■■□□□ 1.11
CNMD-201ENST00000377962 ABCC8Q09428 1581 aa21.97■■□□□ 1.11
CNMD-201ENST00000377962 CUX1P39880 1505 aa21.95■■□□□ 1.1
CNMD-201ENST00000377962 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CNMD-201ENST00000377962 IFT140Q96RY7 1462 aa21.86■■□□□ 1.09
CNMD-201ENST00000377962 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.85■■□□□ 1.09
CNMD-201ENST00000377962 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CNMD-201ENST00000377962 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.83■■□□□ 1.09
CNMD-201ENST00000377962 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CNMD-201ENST00000377962 SYNJ1O43426 1573 aa21.79■■□□□ 1.08
CNMD-201ENST00000377962 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CNMD-201ENST00000377962 SOGA1O94964 1423 aa21.78■■□□□ 1.08
CNMD-201ENST00000377962 TOP2BQ02880 1626 aa21.74■■□□□ 1.07
CNMD-201ENST00000377962 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.74■■□□□ 1.07
CNMD-201ENST00000377962 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
CNMD-201ENST00000377962 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CNMD-201ENST00000377962 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CNMD-201ENST00000377962 WDR97A6NE52 1622 aa21.66■■□□□ 1.06
CNMD-201ENST00000377962 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.6■■□□□ 1.05
CNMD-201ENST00000377962 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.53■■□□□ 1.04
CNMD-201ENST00000377962 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.52■■□□□ 1.04
CNMD-201ENST00000377962 PBRM1Q86U86 1689 aa21.51■■□□□ 1.03
CNMD-201ENST00000377962 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.5■■□□□ 1.03
CNMD-201ENST00000377962 GRIN2BQ13224 1484 aa21.49■■□□□ 1.03
CNMD-201ENST00000377962 CHD1O14646 1710 aa21.48■■□□□ 1.03
CNMD-201ENST00000377962 FBLN2P98095 1184 aa21.46■■□□□ 1.03
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CNMD-201ENST00000377962 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CNMD-201ENST00000377962 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CNMD-201ENST00000377962 TRIM41Q8WV44 630 aa21.36■■□□□ 1.01
CNMD-201ENST00000377962 SYNJ2O15056 1496 aa21.35■■□□□ 1.01
CNMD-201ENST00000377962 ADAMTS12P58397 1594 aa21.32■■□□□ 1
CNMD-201ENST00000377962 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.32■■□□□ 1
CNMD-201ENST00000377962 KIF27Q86VH2 1401 aa21.31■■□□□ 1
CNMD-201ENST00000377962 FOXD1Q16676 465 aa21.3■■□□□ 1
CNMD-201ENST00000377962 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.27■■□□□ 1
CNMD-201ENST00000377962 IGF1RP08069 1367 aa21.26■□□□□ 0.99
CNMD-201ENST00000377962 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.25■□□□□ 0.99
CNMD-201ENST00000377962 GRIN2AQ12879 1464 aa21.23■□□□□ 0.99
CNMD-201ENST00000377962 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.19■□□□□ 0.98
CNMD-201ENST00000377962 CEP170Q5SW79 1584 aa21.17■□□□□ 0.98
CNMD-201ENST00000377962 CUL7Q14999 1698 aa21.15■□□□□ 0.98
CNMD-201ENST00000377962 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.14■□□□□ 0.97
CNMD-201ENST00000377962 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.14■□□□□ 0.97
CNMD-201ENST00000377962 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.14■□□□□ 0.97
CNMD-201ENST00000377962 NUP160Q12769 1436 aa21.12■□□□□ 0.97
CNMD-201ENST00000377962 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.12■□□□□ 0.97
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