Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED5Q9Y3A6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms