Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD2Q9NZN4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD2Q9NZN4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms