Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 34.4
RBM22Q9NW64 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 34.4
RBM22Q9NW64 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 34.4
RBM22Q9NW64 PRC1-211ENST00000556982 583 ntTSL 29.7□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 34.4
RBM22Q9NW64 RBM39-237ENST00000492779 2316 ntTSL 26.51□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 RBM39-221ENST00000461283 2415 ntTSL 52.85□□□□□ -1.953e-7■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.352e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-207ENST00000597663 363 ntTSL 315.63■□□□□ 0.092e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-205ENST00000596962 1237 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.072e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-208ENST00000600283 1414 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.282e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 PGPEP1-204ENST00000595552 418 ntTSL 211.29□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)29.44■■■□□ 2.36e-11■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 222.21■■□□□ 1.156e-11■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.416e-11■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 RCC1-209ENST00000430407 1121 ntTSL 517.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 RCC1-205ENST00000411533 1169 ntTSL 514.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 RCC1-206ENST00000419074 997 ntTSL 513.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 RCC1-208ENST00000429051 538 ntTSL 311.56□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 CDK1-207ENST00000519078 723 ntTSL 36.96□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.892e-7■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.082e-7■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.222e-7■■■■■ 34.3
RBM22Q9NW64 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 NUDT5-209ENST00000537776 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 NUDT5-201ENST00000378927 1258 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 NUDT5-206ENST00000476462 622 ntTSL 29.82□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 NUDT5-207ENST00000491614 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 NUDT5-204ENST00000378952 917 ntTSL 58□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.128e-9■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.764e-10■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 SET-208ENST00000477806 957 ntTSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.594e-10■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.824e-10■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.934e-10■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 22.71□□□□□ -1.984e-10■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.064e-10■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 FUBP1-201ENST00000294623 2201 ntTSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 MAP3K14-201ENST00000344686 4460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 MAP3K14-202ENST00000376926 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 MAP3K14-206ENST00000640087 4583 ntTSL 1 (best)11.55□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 34.2
RBM22Q9NW64 TMEM39A-203ENST00000461654 588 ntTSL 415.45■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 TMEM39A-205ENST00000468676 935 ntTSL 314.94□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 C8orf44-203ENST00000519561 1835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 TMEM39A-211ENST00000491685 852 ntTSL 511.05□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 34.1
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RBM22Q9NW64 TMEM39A-210ENST00000490099 868 ntTSL 39.71□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 C8orf44-204ENST00000521113 575 ntTSL 29.28□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 TMEM39A-208ENST00000486159 826 ntTSL 39.25□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 TMEM39A-202ENST00000438581 4393 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 TMEM39A-209ENST00000486235 885 ntTSL 36.27□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 TMEM39A-212ENST00000497993 590 ntTSL 35.61□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 C8orf44-SGK3-202ENST00000520044 628 ntTSL 35.42□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 SF3B3-202ENST00000562722 881 ntTSL 212.89□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 SF3B3-204ENST00000563739 1105 ntTSL 210.1□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 FUBP3-202ENST00000465949 676 ntTSL 52.77□□□□□ -1.978e-7■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 215.23■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 34.1
RBM22Q9NW64 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.154e-11■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-18■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 CDC42-204ENST00000411827 597 ntTSL 318.99■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.282e-18■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-18■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 57.77□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 PDK1-209ENST00000466437 599 ntTSL 47.69□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 WDR26-208ENST00000486652 2867 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 34
RBM22Q9NW64 WSB1-212ENST00000583096 834 ntTSL 32.58□□□□□ -21e-6■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.715e-7■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 DHX9-207ENST00000485081 2531 ntTSL 211.43□□□□□ -0.584e-8■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 SCRIB-205ENST00000526832 2189 ntTSL 1 (best)18.71■□□□□ 0.594e-8■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 224.15■■□□□ 1.463e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.113e-10■■■■■ 33.8
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