Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LINGO1Q96FE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms