Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RUNDC1Q96C34 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms