Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM78Q5T7P6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms